个人简介
王寿文，2009-2013年获清华大学工程物理系本科学位，并辅修计算机专业。2013－2018年在清华大学获得物理学博士学位。2018-2022年在哈佛大学医学院系统生物学系进行博士后研究工作，主要开发单细胞谱系追踪数据的分析方法，并结合转录组与表观遗传组，进一步理解细胞分化与胚胎发育的基本规律。博士后期间获得了Damon Runyon癌症研究基金会的资助。2023年起，任西湖大学生命科学学院研究员、博士生导师，任西湖大学理学院物理系兼聘教授。
学术成果及研究方向
分裂与分化紧密联系的两个基本的生物学过程。通过细胞分裂的历史，可以更好地认识细胞的分化，并为胚胎发育、组织稳态、疾病发生等问题提供独特的视角。通过分析细胞的分裂历史（谱系），过去人们获得了许多重要的发现，包括细胞凋亡，以及不同组织中的干细胞的存在。
经典的谱系追踪方法依赖于颜色标记，通量太低,大大限制了科学前进的步伐。近十年来，单细胞基因组学的快速发展使我们可以高通量地分析细胞的谱系，又能同时获得细胞的组学状态（包括转录组与表观组）。这为系统地研究细胞的分裂与分化奠定了基础。在谱系追踪与单细胞组学结合的这个方向，王博士做了一系列工作，包括通过建模发现干细胞调控因子(2020, Nature,第三作者)，结合细胞谱系与转录组预测细胞命运(2022, Nature Biotech,一作+共同通讯)，开发新一代谱系追踪小鼠、单细胞多组学技术、以及相应的分析方法 (2023, Cell, 共同通讯)。
目前，谱系追踪与单细胞组学结合这个领域正处于蓬勃发展的新阶段。实验室致力于结合谱系追踪与单细胞多组学技术，深入理解细胞的命运选择，以及组织的发生、维持、病变等基本生物学问题。实验室有着深厚的数据分析与算法开发的基础。我们立足于领域的技术前沿，开发最新的分析方法，并与其他实验课题组深度合作，回答具体的生物学问题。与此同时，我们也搭建了自己的实验平台，进行多组学谱系追踪实验，并试图回答与谱系和细胞命运相关的更为一般的问题。实验室目前已有多个不同背景的团队成员，氛围融洽，学术交叉，非常适合想学习新技术、进入新领域的优秀青年！本实验室现有多个博士后，博士研究生，科研助理等岗位。欢迎计算生物学、实验生物学、物理学、计算机科学等不同学科背景的人加盟。
代表论文（*代表通讯作者）
1. J. Gao+, Z. Zhang+, D. Chen, S. Diao, S. Liu, S-W. Wang*, & L. Li*, Spatio-DARLIN enables robust and efficient in situ lineage tracing in mice at single-cell resolution, Nature Methods (2026).
2. Z. Kang, H. Chen, S. Li, S-W. Wang* & B. Zhou*, Evolving strategies for lineage tracing: Genetic markers, synthetic barcodes, and natural variants, Cell Stem Cell (2026).
3. S-W. Wang*, Reading cell division histories from the methylome, Nature Reviews Genetics (2026).
4. R. Fu, M. Chen, S-W. Wang*, DNA methylation meets lineage tracing: History, recent progress, and future directions, Quantitative Biology (2025)
5. L. Li+, S. Bowling+, H. Lin, D. Chen, S-W. Wang* & F. D. Camargo*, DARLIN mouse for in vivo lineage tracing at high efficiency and clonal diversity, Nature Protocols (2025)
6. S-W. Wang*, MethylTree: exploring epimutations for accurate and non-invasive lineage tracing, Nature Methods (2025)
7. M. Chen+, R. Fu+, Y. Chen, L. Li* & S-W Wang*, High-resolution, noninvasive single-cell lineage tracing in mice and humans based on DNA methylation epimutations, Nature Methods (2025)
8. L. Li, S. Bowling, S. E. McGeary, Q. Yu, B. Lemke, K. Alcedo, Y. Jia, X. Liu, M. Ferreira, A. M. Klein, S.-W. Wang*, F. D. Camargo*, A mouse model with high clonal barcode diversity for joint lineage, transcriptomic, and epigenomic profiling in single cells, Cell (2023).
9. S.-W. Wang*, M. J. Herriges, K. Hurley, D. N. Kotton, A. M. Klein*, CoSpar identifies early cell fate biases from single cell transcriptomic and lineage information, Nature Biotechnology (2022).
10. A. E. Rodriguez-Fraticelli, C. S. Weinreb, S.-W. Wang, R. P. Migueles, M. Jankovic, M. Usart, A. M. Klein, S. Lowell, F. D. Camargo*, Combined single cell lineage and transcriptome sequencing reveals Tcf15 as a master regulator of hematopoietic stem cell fate, Nature (2020).
11. S.-W. Wang*, L.-H. Tang*, Emergence of collective oscillations in adaptive cells, Nature Communications (2019).
12. S.-W. Wang, A.-F. Bitbol*, N. S. Wingreen*, Revealing evolutionary constraints on proteins through sequence analysis, PLOS Computational Biology (2019).
13. S.-W. Wang, K. Kawaguchi, S.-i. Sasa and L.-H. Tang, Entropy production of nanosystems with time scale separation, Physical Review Letters (2016).
联系方式
电子邮箱：wangshouwen@westlake.edu.cn
网页：https://www.shouwenwang-lab.com/
